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转录组测序助力发现APL新型三段式融合基因 HNRNPC::RARB::HNRNPC

 

 

 

 

近日,见康华美实验室在International Journal of Laboratory Hematology期刊首次报道伴HNRNPC::RARB::HNRNPC三段式融合基因的急性早幼粒细胞白血病(APL)病例,并介绍了其临床表型、基因组结构及全反式维甲酸 (ATRA) 原发性耐药的核心机制,为非典型APL (aAPL) 的精准诊断与个体化治疗提供了重要依据。

原文链接:https://doi.org/10.1111/ijlh.70261

 

病例介绍

1.典型APL形态及免疫表型,无经典PML::RARA融合

患者34岁男性,因乏力、发热、牙龈肿胀伴体重下降就诊,实验室检查结果显示白细胞升高、贫血、血小板减少及严重凝血功能紊乱,符合APL的典型临床特征。

•骨髓形态学:骨髓增生极度活跃,异常早幼粒细胞占有核细胞88.0%,伴大量Auer小体,符合APL形态学表现;

•流式细胞学:异常髓系原始/幼稚细胞占有核细胞84.8%,CD117、CD33、CD13、MPO、CD9阳性;CD15、CD64部分阳性;CD34、HLA-DR、CD38阴性,符合APL免疫表型特征;

•细胞遗传学及分子生物学:未检出经典APL标志性的t(15;17)易位及PML::RARA 融合基因。

2.转录组测序检出HNRNPC::RARB::HNRNPC三段式融合

通过转录组测序发现该患者存在RARB 融合,但不是传统的X::RARB 融合形式,而是全新的三段式融合。融合转录本由三部分组成:HNRNPC基因外显子1~3、RARB基因外显子2~7、HNRNPC基因外显子4~9(见下图)。该融合基因同时经PCR与Sanger测序验证。

三段式融合示意图

 

 

3. LBD 结构域破坏介导ATRA原发性耐药

经典APL中,PML::RARA融合蛋白保留了视黄酸受体的配体结构域 (LBD),ATRA 可通过结合该结构域启动白血病细胞分化程序。

本病例三段式融合基因缺失了RARB基因外显子8,直接破坏了LBD结构域的完整性,导致ATRA无法正常结合,白血病细胞分化通路受阻,最终导致ATRA原发性耐药。 

4. 挽救化疗方案对ATRA原发性耐药有效

一线治疗采用ATRA联合三氧化二砷及伊达比星的标准诱导方案,3周后复查显示,骨髓中异常早幼粒细胞仍占78.5%,无形态学及免疫表型分化证据,提示诱导失败。

换用HAEV挽救方案(高三尖杉酯碱+阿糖胞苷+依托泊苷+维奈克拉)再诱导后,患者获得完全缓解;后续进行维奈克拉联合阿扎胞苷维持治疗,持续处于完全缓解状态。

 

小  结

HNRNPC::RARB::HNRNPC三段式融合基因的发现,进一步拓展了aAPL 的融合基因谱。此外,这一结果提示临床,对于aAPL患者,需借助转录组测序筛查融合基因,早期识别ATRA耐药风险,及时调整治疗策略,改善患者预后。

 

 

 

 

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作者:陈斌

 

参考文献:

Chen B, Zhang D, Chen L, Lin Y, Ru K. A Rare Case of Acute Promyelocytic Leukemia With HNRNPC::RARB::HNRNPC Tripartite Fusion and De Novo Resistance to All-Trans Retinoic Acid. Int J Lab Hematol. 2026 Oct 23. doi: 10.1111/ijlh.70261. Epub ahead of print. PMID: 42922374.